16S、18S、ITS等擴增子測序

產品介紹常見問題經典案例結果展示


16S、18S、ITS等擴增子測序

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一步到位檢測環境微生物多樣性

擴增子測序是對特定長度的PCR產物或捕獲的片段進行測序,分析序列中的變異。
16S/18S/ITS等擴增子測序即通過提取環境樣品的DNA,選擇合適的通用引物擴增16S/18S/ITS的目標區域,
通過檢測目標區域的序列變異和豐度,以研究環境微生物多樣性及群落組成差異。
16S/18S rDNA為編碼原/真核生物核糖體小亞基rRNA的DNA序列。
ITS分為兩個區域:ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之間,ITS2位于5.8S和28S之間。

讀長長, 周期短, 性價比高。

采用 Ion S5 XL 測序平臺和 NovaSeq 6000 測序平臺。NovaSeq 6000 測序平臺通量更高,速度更快,運行時間更短,周期最短可達10天。Ion S5 XL測序平臺單端測序,無需拼接,SE400/SE600 兩種模式。兩種平臺,為擴增子測序提供更多的選擇。

科學方案設計

從材料選取,建庫測序,到數據分析,
每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。

信息分析

分析內容=標準分析+高級分析。
基于目標區域的測序,檢測序列豐度,以充分研究環境微生物多樣性和
群落結構差異性。

高級分析 解決問題
腸型分析 腸道菌準確定位和疾病預測和治療
貝葉斯網絡圖 判斷微生物之間、微生物和環境、
代謝物間的依賴關系
Source Tracker 樣本中微生物群落來源
標準分析 解決問題
物種注釋 物種注釋及各物種豐度信息
α-多樣性分析 微生物群落的豐富度和多樣性
β-多樣性分析 不同樣本間的微生物群落
及各樣本差異情況
多元統計分析 尋找組間具有顯著差異的物種,
同時可以比較組內差異和組間差異
的大小,判斷分組是否有意義
CCA分析 研究物種組成與環境因子間的關系
環境因子關聯分析
VPA分析
功能預測 預測樣本的功能組成

擴增子測序解密環境微生物多樣性

諾禾致源基于多樣性的測序區域選擇,結合研究目的和樣品自身的特點,
靈活制定研究方案,用專業成熟的樣本
制備、建庫以及數據分析流程,客觀還原樣品本身的菌群結構以及豐度。

悅讀高質量測序數據,盡享HPC澎湃動力

擴增子測序采用先進的Ion S5 XL測序平臺和NovaSeq 6000測序平臺,快速、高效地讀取高質量的測序數據。
諾禾致源高性能計算平臺(High Performance Computing,HPC)采用DELL計算節點和Isilon存儲的高效組合,
實現快速穩定的測序數據分析及交付。隨著公司業務的發展,高性能計算平臺將會持續更新并擴容,
以保證高效的數據處理和安全的數據存儲。

項目經驗豐富

至2017年12月,諾禾致源諾禾16S樣本數突破220,000例,
包括土壤、水體、糞便、淤泥、發酵物等樣本。
“科學的方案設計,嚴格的質控管理,專業的分析團隊,豐富的項目經驗,優質的項目服務”
確保每一個環節都能出色完成,助力科學研究。

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